Nhất trí với nội dung cơ bản của dự thảo đề án do Bộ GD-ĐT trình nhưng Phó thủ tướng cho rằng cần rà soát để lựa chọn các nhiệm vụ phù hợp được giao cho các trường tự quyết định và chịu trách nhiệm, gắn với chuẩn kết quả thực hiện để phục vụ công tác kiểm tra, đánh giá.
Bên cạnh đó, Bộ Nội vụ và Bộ GD-ĐT phải căn cứ thực tiễn đễ xây dựng tiêu chí tuyển chọn và chỉ tiêu tổng biên chế viên chức tối đa của từng trường trong thời gian thí điểm, xây dựng chế độ trả lương, các quy định về nguồn thu được phép và không được phép, chế độ phân phối tài chính, trong đó khuyến khích chính sách chi thưởng, nâng cao năng suất, chất lượng lao động.
Theo đề xuất của Bộ GD-ĐT, 4 trường sẽ áp dụng đổi mới cơ chế hoạt động gồm có ĐH Ngoại thương, ĐH Hà Nội, ĐH Kinh tế quốc dân, ĐH Kinh tế TP.HCM.
Cũng theo Phó thủ tướng Vũ Văn Ninh, các đề án của ĐH Quốc gia Hà Nội và ĐHQG TP.HCM phải nghiên cứu để lồng ghép đưa các nội dung liên quan đến hai đại học vào dự thảo để xem xét phê duyệt.
